对于每条染色体,在正常样本的

变异等位基因频率落在和之间的位点绘制了肿瘤和正常样本的变异等位基因频率。肿瘤样本中变异体经常表现出高度可变的变异等位基因频率的染色体被排除在克隆性分析之外。因此,仅选择一些二倍体染色体来代表该分析的每个样本。剩余的根据cnv预测的分段拷贝数状态(拷贝数状态等于、或)进一步分离,并单独分析每个拷贝数状态。对于肿瘤中的每个拷贝数状态,使用中的密度函数绘制肿

瘤变异等位基因频率的核密度估计图 定制的函数

评估每个图,以确定存在于中的变异中显着峰的数量。拷贝数中性或二倍体区域。这些簇可用于估计每个肿瘤中存在的克隆和亚克隆的数量和相对组成。仅显示拷贝数中性数据图显着突变基因分析显着突变基因的确定如下迪斯等人,表中列出了每个案例进行验证的。对于小插入和,目标区域恰好位于变体中心的bp处。对于小删除,选择删除的序玻利维亚 WhatsApp 号码列表列加上删除两端侧翼的bp序列。对于假定的体细胞,我们要求探针平铺在预测的断点上,并在这些位置的两侧各有bp的侧翼序列。

对于较大的插入,需要单个区域,但对于易位

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、删除和倒位,我们请求两个目标,一个用于事件每一侧的断点。ocheimbleen设计参数允许探针在基B2B电话列表因组其他位置具有最多五个额外的序列匹配。突变预测的固相捕获验证llumina文库是根据制造商的方案lluminanc,aniego,从全基因组扩增样本μg构建的,并进行以下修改:使用ovaris超声波仪ovaris,nc沃本,马萨诸塞州)。片段大小范围在至bp之间。llumina接头连接的在单次μl中扩增五个循环。使用固相可逆固定化珠净化