壤和实验中的差异。对于实验我们每个条件至少使用四个重复这足以使用软件进行参数估计。和多样性是根据精简至个读数的计数表计算的。可用读数少于该数量的样本即高质量非细胞器读数被丢弃。多样性香农指数丰富度指标是使用中的“多样性”函数计算的并使用方差分析测试了组之间的差异扩展数据图。站点多样性扩展数据图是用中的“”函数计算的。使用进行无约束排序并使用进行主坐标分析扩展数据图．主坐标规范分析是约束排序的一种形式是使用中包
函数执行的仅使用“”距离对样本的完整计数进行对植物基因型分别进
行限制同时以测序深度和生物复制为条件。这种方法使我们能够有电子、电气制造商电子邮件列表条件地独立于其他因素地关注与植物基因型相关的变异部分。对于实验丰富度直接在中计算。主坐标分析是使用的“”功能使用“”距离进行的该距离是使用在每个样本稀疏到个读数的丰度表上计算得出的。使用中包的“”函数执行主坐标规范分析。仅使用“”距离对根样本的完整计数执行。分别对分数水平和植物基因型进行约束同时对测序深度和其他协变量进行调节。使用与等人相同的方法鉴定了野生土壤实
验中跨部分和基因型的差异丰度细菌类群简而言之我们使
用了零膨胀负二项式框 B2B电话列表 架该框架允许我们测试特定变量的影响同时控制其他协变量并考虑丰度表中过多的零条目。这些零条目可能代表抽样不足而不是真正的缺席。在科和水平上对可测量的在至少个样本中具有至少个计数的丰度的类群进行了相同的分析。结果在扩展数据图补充表。扩展数据图显示两个分类水平上细菌丰度显着基因型效应的分布；在这两种情况下行为是相似的表明所有基因型的影响很小而且均匀。为了比较基因型之间的富
