酶对片段进行腺苷酸化以连接接头和。所有酶均购自。文库制备后分别使用生物分析仪和试剂进行质量控制和定量。单端读数。数据分析使用对读数进行初始质量评估。用于识别并丢弃包含接头序列的读数。然后使用将所得高质量读数映射到拟南芥参考基因组参数设置为仅允许一个不匹配并丢弃映射到参考中多个位置的任何读数。包用于对映射到个核蛋白编码基因中每一
个的读数进行计数扩展数据图显示每个库的唯一映射读取
计数的摘要。原始测序数据和读数计数可在登录号中获得。使用特殊贸易承包商电子邮件列表在包中实施的广义线性模型方法来进行差异基因表达分析。该软件经过专门开发和优化用于处理产生的过度分散的计数数据。使用值的修剪平均值方法；中的函数进行归一化。函数用于通过对数链接函数拟合负二项式广义线性模型中的计数。对于实验图模型包括协变量磷酸盐含量高或低细菌存在或不存在和批次效应。包括磷酸盐和细
菌之间相互作用的术语如下所示表磷酸盐细菌磷酸盐细菌批次
用于分析和效果的模型 B2B电话列表 图包括以下协变量磷酸盐含量高或低存在或不存在存在或不存在和批次效应。表达=磷酸盐在每个模型中术语“批次”是指实验的独立重复参见全基因组基因表达分析部分。来自不同基因型的数据独立地与相同的模型变量拟合。执行多重比较后应用方法错误发现率；来校正值。低于或等于且倍数变化变异至少为的基因被认为是差异表达的。使用一组文献策划的磷酸盐饥饿标记基因研究了磷酸盐饥饿反应的转
